MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011988	TGGC	2	8	26299	26306	0 %	25 %	50 %	25 %	222106153
502	NC_011988	ATTG	2	8	26387	26394	25 %	50 %	25 %	0 %	222106153
503	NC_011988	CGA	2	6	26450	26455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106153
504	NC_011988	ATC	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106153
505	NC_011988	GTT	2	6	26534	26539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106153
506	NC_011988	CCG	2	6	26560	26565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106153
507	NC_011988	TAA	2	6	26572	26577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106153
508	NC_011988	GCC	2	6	26598	26603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106153
509	NC_011988	TCG	2	6	26647	26652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106153
510	NC_011988	CAA	2	6	26687	26692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106153
511	NC_011988	TGG	2	6	26816	26821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106154
512	NC_011988	GCG	2	6	26894	26899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106154
513	NC_011988	CAA	2	6	26929	26934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106154
514	NC_011988	GCT	2	6	26936	26941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106154
515	NC_011988	CGA	2	6	27015	27020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106154
516	NC_011988	CGG	2	6	27033	27038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106154
517	NC_011988	CG	3	6	27309	27314	0 %	0 %	50 %	50 %	222106154
518	NC_011988	CAT	2	6	27325	27330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106154
519	NC_011988	GGC	2	6	27406	27411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106154
520	NC_011988	GAT	2	6	27448	27453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106154
521	NC_011988	CTTT	2	8	27660	27667	0 %	75 %	0 %	25 %	222106154
522	NC_011988	TGA	2	6	27677	27682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011988	A	6	6	27692	27697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011988	CAA	2	6	27734	27739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_011988	TGT	2	6	27741	27746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011988	GGA	2	6	27759	27764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011988	CGC	2	6	27799	27804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106155
528	NC_011988	GCA	2	6	27862	27867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106155
529	NC_011988	AAGCT	2	10	27899	27908	40 %	20 %	20 %	20 %	222106155
530	NC_011988	GCC	5	15	27910	27924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106155
531	NC_011988	CCA	2	6	28007	28012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106155
532	NC_011988	CAA	2	6	28035	28040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106155
533	NC_011988	GCT	2	6	28098	28103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106155
534	NC_011988	GGC	3	9	28140	28148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106155
535	NC_011988	GCG	2	6	28166	28171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106155
536	NC_011988	ATC	2	6	28180	28185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106155
537	NC_011988	CGAC	2	8	28280	28287	25 %	0 %	25 %	50 %	222106155
538	NC_011988	TGCAA	2	10	28304	28313	40 %	20 %	20 %	20 %	222106155
539	NC_011988	CGC	2	6	28340	28345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106155
540	NC_011988	GGA	2	6	28425	28430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106155
541	NC_011988	TGG	2	6	28433	28438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106155
542	NC_011988	TGG	2	6	28503	28508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106155
543	NC_011988	GTG	2	6	28538	28543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106156
544	NC_011988	GT	3	6	28560	28565	0 %	50 %	50 %	0 %	222106156
545	NC_011988	TCC	2	6	28580	28585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106156
546	NC_011988	GGC	2	6	28600	28605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106156
547	NC_011988	CGA	2	6	28633	28638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106156
548	NC_011988	CCG	2	6	28646	28651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106156
549	NC_011988	GCAG	2	8	28669	28676	25 %	0 %	50 %	25 %	222106156
550	NC_011988	CATC	2	8	28831	28838	25 %	25 %	0 %	50 %	222106156
551	NC_011988	TGGC	2	8	28839	28846	0 %	25 %	50 %	25 %	222106156
552	NC_011988	GCT	2	6	28906	28911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106156
553	NC_011988	CCG	2	6	28937	28942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106156
554	NC_011988	GAG	2	6	29024	29029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106156
555	NC_011988	CAAC	2	8	29109	29116	50 %	0 %	0 %	50 %	222106157
556	NC_011988	GCG	2	6	29188	29193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106157
557	NC_011988	CAT	2	6	29244	29249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106157
558	NC_011988	GCC	2	6	29254	29259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106157
559	NC_011988	TCC	2	6	29320	29325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106157
560	NC_011988	GCG	2	6	29362	29367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106157
561	NC_011988	GGC	2	6	29418	29423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106157
562	NC_011988	TGGC	2	8	29444	29451	0 %	25 %	50 %	25 %	222106157
563	NC_011988	GCA	2	6	29490	29495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106157
564	NC_011988	GGTG	2	8	29526	29533	0 %	25 %	75 %	0 %	222106157
565	NC_011988	ACC	2	6	29542	29547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106157
566	NC_011988	TG	3	6	29567	29572	0 %	50 %	50 %	0 %	222106157
567	NC_011988	TCC	2	6	29681	29686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106157
568	NC_011988	AT	3	6	29691	29696	50 %	50 %	0 %	0 %	222106157
569	NC_011988	CGC	2	6	29722	29727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106157
570	NC_011988	GC	3	6	29765	29770	0 %	0 %	50 %	50 %	222106157
571	NC_011988	CGA	2	6	29782	29787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106157
572	NC_011988	GCG	2	6	29845	29850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106157
573	NC_011988	TGA	2	6	29917	29922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106157
574	NC_011988	GCT	2	6	29982	29987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106158
575	NC_011988	TGA	2	6	30065	30070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106158
576	NC_011988	GAT	2	6	30089	30094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106158
577	NC_011988	GGC	2	6	30131	30136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106158
578	NC_011988	CCA	2	6	30212	30217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106158
579	NC_011988	TCACG	2	10	30218	30227	20 %	20 %	20 %	40 %	222106158
580	NC_011988	TCG	2	6	30260	30265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011988	TCCCC	2	10	30268	30277	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
582	NC_011988	GGGT	2	8	30284	30291	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011988	GT	3	6	30430	30435	0 %	50 %	50 %	0 %	222106159
584	NC_011988	AGA	2	6	30515	30520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106159
585	NC_011988	TTG	2	6	30577	30582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106159
586	NC_011988	AAT	2	6	30603	30608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106159
587	NC_011988	CGGT	2	8	30625	30632	0 %	25 %	50 %	25 %	222106159
588	NC_011988	TC	3	6	30635	30640	0 %	50 %	0 %	50 %	222106159
589	NC_011988	GAA	2	6	30705	30710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106159
590	NC_011988	TTG	2	6	30726	30731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106159
591	NC_011988	TCG	2	6	30751	30756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106159
592	NC_011988	CGG	2	6	30761	30766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106159
593	NC_011988	GTCG	2	8	30951	30958	0 %	25 %	50 %	25 %	222106159
594	NC_011988	AC	3	6	30961	30966	50 %	0 %	0 %	50 %	222106159
595	NC_011988	CGC	2	6	30978	30983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106159
596	NC_011988	CGC	2	6	31037	31042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106159
597	NC_011988	GCT	2	6	31091	31096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106159
598	NC_011988	GCG	2	6	31172	31177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106159
599	NC_011988	CGA	2	6	31249	31254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106159
600	NC_011988	ACC	2	6	31257	31262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106159
601	NC_011988	AGC	2	6	31295	31300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106159
602	NC_011988	CTG	2	6	31317	31322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106159
603	NC_011988	GGC	2	6	31327	31332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106159
604	NC_011988	CATCAC	2	12	31346	31357	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222106159
605	NC_011988	CAG	2	6	31379	31384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106159
606	NC_011988	CAC	2	6	31533	31538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106160
607	NC_011988	GCG	2	6	31544	31549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106160
608	NC_011988	CCA	2	6	31598	31603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106160
609	NC_011988	C	6	6	31726	31731	0 %	0 %	0 %	100 %	222106160
610	NC_011988	GGT	2	6	31830	31835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106160
611	NC_011988	GCC	2	6	31896	31901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106160
612	NC_011988	TGGCGA	2	12	31937	31948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222106160
613	NC_011988	GAT	2	6	31971	31976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106160
614	NC_011988	GGC	3	9	32016	32024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106160
615	NC_011988	GTCCG	2	10	32079	32088	0 %	20 %	40 %	40 %	222106160
616	NC_011988	TGG	2	6	32090	32095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106160
617	NC_011988	GAT	3	9	32181	32189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106160
618	NC_011988	GGC	2	6	32289	32294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106160
619	NC_011988	CCA	2	6	32326	32331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106160
620	NC_011988	CCAG	2	8	32344	32351	25 %	0 %	25 %	50 %	222106160
621	NC_011988	AAC	2	6	32352	32357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106160
622	NC_011988	GTCC	2	8	32396	32403	0 %	25 %	25 %	50 %	222106160
623	NC_011988	ACC	2	6	32434	32439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106160
624	NC_011988	ATCGG	2	10	32455	32464	20 %	20 %	40 %	20 %	222106160
625	NC_011988	CCG	2	6	32477	32482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106160
626	NC_011988	TTGC	2	8	32504	32511	0 %	50 %	25 %	25 %	222106160
627	NC_011988	TCC	2	6	32538	32543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_011988	TTG	2	6	32573	32578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106161
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762	NC_011988	TGAT	2	8	38671	38678	25 %	50 %	25 %	0 %	222106164
763	NC_011988	CGG	2	6	38704	38709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106164
764	NC_011988	CGC	2	6	38737	38742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106164
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766	NC_011988	GCA	2	6	38854	38859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
767	NC_011988	TA	3	6	38860	38865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
768	NC_011988	TAC	2	6	38867	38872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_011988	T	7	7	38936	38942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_011988	GGA	2	6	38944	38949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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874	NC_011988	GGC	2	6	44882	44887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106170
875	NC_011988	TCG	2	6	44904	44909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106170
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878	NC_011988	CCG	2	6	45042	45047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106170
879	NC_011988	GGGC	2	8	45058	45065	0 %	0 %	75 %	25 %	222106170
880	NC_011988	TGG	2	6	45109	45114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106170
881	NC_011988	CCA	2	6	45163	45168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106170
882	NC_011988	GCA	2	6	45174	45179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106170
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884	NC_011988	TGA	2	6	45205	45210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106170
885	NC_011988	CTG	2	6	45382	45387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106170
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887	NC_011988	GGC	2	6	45464	45469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106170
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1000	NC_011988	GCC	2	6	50161	50166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106174

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